تمكنت مؤسسة التعاون من الحصول على شهادة الجودة العالمية الآيزو 9001، بعد ان تم تطوير نظام إدارة الجودة في دائرة الشؤون الإدارية والمالية، وذلك بمساعدة النخبة للاستشارات الإدارية. حيث قامت المؤسسة بالتعاون مع فريق النخبة بتنفيذ مشروع الجودة في المؤسسة وفقاً لتحليل متكامل لواقع العمل وتحديد نقاط القوة والضعف، وعليه تمت إعادة هيكلية الوحدات الإدارية وبناء نظام راسخ لتنظيم الأعمال وتحديد المهام وتحسين الجودة.